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对于疫苗，也同样付出了大量的努力，尤其是针对鼻病毒的疫苗。（感冒还可能由腺病毒、冠状病毒和其他病毒引起。）和HIV类似，鼻病毒的RNA基因组也包裹在一层被称为“衣壳”的蛋白质外壳之中。病毒会先附着在宿主细胞的细胞膜上，把自身的遗传物质注入宿主细胞中，然后劫持宿主的细胞器进行自身复制。引发感冒症状的是机体自身的炎症免疫应答，而非病毒复制过程。

在寻找鼻病毒的疫苗候选者的过程中，研究者集中全部精力寻找所有病毒衣壳的共有片段。理论上讲，给一个健康的人注入含有这种片段的疫苗，就会让免疫系统产生针对该片段的抗体，这个人就可以抵挡含有此片段的所有病毒株的感染。研究的目标是找到一段不会随时间流逝发生较大改变的共有片段。要知道，这个片段一次重大的变化，就足以让最好的疫苗和药物变得一文不值。

在多年来寻找鼻病毒保守片段的工作中，研究者遭受了接二连三的打击。他们检查了一百多种病毒的变种，却没发现它们存在任何共同点，托马斯·J·史密斯（Thomas J. Smith）如是说。他在位于圣路易斯的唐纳德·丹福思植物科学中心（Donald Danforth Plant Science Center）研究病毒结构。出现这些分异的原因是，作为一种RNA病毒，鼻病毒非常容易变异。复制RNA的酶并不具备复制DNA的酶使用的那种校准机制，所以每一个新病毒都可能在编码上有所变化，每个变化都会造成衣壳组成的大变样。相比较而言，我们目前已经研发出了对抗腺病毒（一种DNA病毒）的疫苗，尽管目前该疫苗只限于军用。

不过，十多年前，史密斯曾惊奇地发现，研究者过去认为埋在深部从而淡出免疫系统视线的某些鼻病毒片段，其实也会出现于表面，至少某些时刻会在表面出现。他和同事最终得出结论，认为衣壳可能比从前预想的更富动态，会不断变化，并暴露出隐藏的区域，他们把这一过程称为“呼吸”。